Novel coronavirus SARS-CoV-2
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Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2.
Après acquisition des images en 2D avec le microscope Titan Krios, on peut procéder à la transformation de ces images en 3 Dimensions (3D) avec un programme appelé IMOD. On voit alors plus clairement que le SARS-CoV2 est présent à la fois sur et dans les connexions.
L'objectif de l'étude est d'explorer comment le SARS-CoV-2 atteint le cerveau. Expérience réalisée par Anna Pepe sous la supervision de Chiara Zurzolo, directrice de l'unité Trafic membranaire et pathogénèse. Les échantillons cryogéniques ont été acquis par Anna Pepe en utilisant le microscope Krios-Titan à l'Institut Pasteur (Nanoimaging Institut Pasteur).
Institut Pasteur/Anna Pepe et Chiara Zurzolo 65077
Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2 -
Cette vidéo montre les connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2.
L'objectif de l'étude est d'explorer comment le SARS-CoV-2 atteint le cerveau. Expérience réalisée par Anna Pepe sous la supervision de Chiara Zurzolo, directrice de l'Unité Trafic membranaire et pathogénèse.
Les échantillons cryogéniques ont été acquis par Anna Pepe en utilisant le microscope Krios-Titan à l'Institut Pasteur (Nanoimaging Institut Pasteur).
Institut Pasteur/Anna Pepe & Chiara Zurzolo 65071
Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2 -
Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron, vue latérale.
Les mutations sont indiquées en rouge. Les mutations sont présentes sur toute la protéine Spike, mais s’accumulent au niveau de la zone de liaison au récepteur (Receptor Binding Domain ou RBD, coloré en jaune) et dans une région appelée N-terminal Domain (NTD).
Institut Pasteur/Olivier Schwartz et Félix Rey 64307
Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron -
Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron, vue de dessus.
Les mutations sont indiquées en rouge. Les mutations sont présentes sur toute la protéine Spike, mais s’accumulent au niveau de la zone de liaison au récepteur (Receptor Binding Domain ou RBD, coloré en jaune) et dans une région appelée N-terminal Domain (NTD).
Institut Pasteur/Olivier Schwartz et Félix Rey 64306
Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron -
Plusieurs cellules connectées par des nanotubes.
Institut Pasteur/Trafic Membranaire et Pathogénèse 63295
Plusieurs cellules connectées par des nanotubes. -
Des particules virales de SARS-CoV-2 (en bleu foncé) à l’intérieur et à la surface d’un nanotube. Tomographie Cryo-EM segmentée réalisée avec le logiciel AMIRA.
Le SARS-CoV-2 détourne les nanotubes reliant les neurones afin de les infecter.
Institut Pasteur/Anna Pepe 63294
Particules virales de SARS-CoV-2 à l’intérieur et à la surface d’un nanotube -
Le SARS-CoV-2 (en jaune) se propage à travers les nanotubes entre des cellules infectées. Rendu 3D d'une micrographie confocale réalisée avec le logiciel IMARIS.
Institut Pasteur/Anna Pepe 63293
Le SARS-CoV-2 (en jaune) se propage à travers les nanotubes -
Vidéo de cellules dérivées d’un cerveau de grand murin (Myotis myotis) infectées par le SARS-CoV-2 (à droite) ou non-infectées (à gauche).
Les cellules sont cultivées dans un milieu contenant de l'iodure de propidium comme marqueur de mort cellulaire. Les cellules ont été photographiées toutes les 15 minutes pendant 48 heures.
Institut Pasteur/Delphine Planas, Sophie Aicher, Nolwenn Jouvenet 63234
Infection de cellules de chauve-souris par le SARS-CoV-2 -
Cellules humaines infectées par SARS-CoV-2.
En vert les cellules ayant fusionné et formé des syncytia, en rouge, production de la Spike, en bleu les noyaux cellulaires.
Institut Pasteur 62711
Cellules humaines infectées par SARS-CoV-2 -
Microscopie électronique à balayage montrant les changements de l’épithélium olfactif après infection par le SARS-CoV-2.
A la périphérie de la photo, les cellules ciliées sont normales. Au centre : perte de cils 4 jours après infection. Les particules virales bourgeonnent à la surface des cellules infectées ayant perdu leurs cils.
Institut Pasteur/Unité Perception et Mémoire 62710
Changements de l’épithélium olfactif après infection par le SARS-CoV-2 -
Microscopies électronique à balayage montrant les changements de l’épithélium olfactif après infection par le SARS-CoV-2.
A gauche muqueuse olfactive non infectée
Au centre muqueuse olfactive 4 jours post infection
A droite, les particules virales bourgeonnent à la surface des cellules infectées ayant perdu leurs cils.
Institut Pasteur/Unité Perception et Mémoire 62709
Changements de l’épithélium olfactif après infection par le SARS-CoV-2. -
Image par microscopie électronique à balayage d’une cellule ciliée (en vert) infectée par le SARS-CoV-2, avec quelques cils restants et des particules virales (colorisées en bleu) dispersées au niveau de la membrane plasmique.
Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62630
Cellule ciliée infectée par le SARS-CoV-2 -
Cellules bronchiques humaines (en bleu) infectées par SARS-CoV-2 (orange). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti. Colorisation Jean Marc Panaud 62276
Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2 -
Cellules bronchiques humaines (en orange) infectées par SARS-CoV-2 (vert). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62020
Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2 -
Cellules bronchiques humaines (en bleu) infectées par SARS-CoV-2 (orange). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62019
Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2 -
Cellules bronchiques humaines (en bleu) infectées par SARS-CoV-2 (orange). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62018
Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2 -
Cellules bronchiques humaines (en bleu) infectées par SARS-CoV-2 (rose). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62017
Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2 -
Cellules bronchiques humaines (en vert) infectées par SARS-CoV-2 (orange). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62016
Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2 -
Arbre phylogénétique calibré dans le temps de 950 génomes du SARS-CoV-2 partagés librement par la communauté scientifique. Les pointes de l’arbre sont colorées en fonction de leur date échantillonnage.
Arbre inféré et visualisé avec Nextstrain (Hadfield et al., Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution, Bioinformatics (2018)).
Institut Pasteur/Etienne Simon-Lorière - Génomique évolutive des virus à ARN 61931
Arbre phylogénétique de 950 génomes du SARS-CoV-2 -
Zoom sur la séquence complète du coronavirus 2019-nCoV (SARS-Cov-2), chez un des premiers cas français, réalisée à l'Institut Pasteur. On voit les bases de l'ARN viral.
Institut Pasteur/CNR des virus des infections respiratoires à l’Institut Pasteur 61442
Zoom sur la séquence complète du coronavirus 2019-nCoV