Novel coronavirus SARS-CoV-2

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  • Zoom sur la séquence complète du coronavirus 2019-nCoV
    Zoom sur la séquence complète du coronavirus 2019-nCoV (SARS-Cov-2), chez un des premiers cas français, réalisée à l'Institut Pasteur. On voit les bases de l'ARN viral.
    Institut Pasteur/CNR des virus des infections respiratoires à l’Institut Pasteur 61442
    Zoom sur la séquence complète du coronavirus 2019-nCoV

     

  • Effet cytopathogène du Coronavirus 2019-nCoV sur cellules Vero E6
    Effet cytopathogène du Coronavirus 2019-nCoV (SARS-Cov-2) sur cellules Vero E6.
    A gauche, tapis cellulaire non abîmé par les virus. A droite, tapis cellulaire avec effet cytopathogène (ECP) visible, les cellules infectées par le virus sont détruites.

    Institut Pasteur/CNR des virus des infections respiratoires à l’Institut Pasteur 61440
    Effet cytopathogène du Coronavirus 2019-nCoV sur cellules Vero E6

     

  • Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2
    Cellules bronchiques humaines (en bleu) infectées par SARS-CoV-2 (orange). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
    Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62018
    Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2

     

  • Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2
    Cellules bronchiques humaines (en bleu) infectées par SARS-CoV-2 (orange). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
    Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti. Colorisation Jean Marc Panaud 62276
    Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2

     

  • Séquence complète du coronavirus 2019-nCoV
    Séquence complète du coronavirus 2019-nCoV (SARS-Cov-2), chez un des premiers cas français, réalisée à l'Institut Pasteur, à l'aide de la Plateforme de microbiologie mutualisée (P2M), ouverte à tous les Centres nationaux de référence (CNR).
    Institut Pasteur / CNR des virus des infections respiratoires à l’Institut Pasteur 61441
    Séquence complète du coronavirus 2019-nCoV

     

  • Effet cytopathogène du Coronavirus 2019-nCoV sur cellules Vero E6
    Effet cytopathogène du Coronavirus 2019-nCoV (SARS-Cov-2) sur cellules Vero E6.
    Tapis cellulaire avec effet cytopathogène (ECP) visible, les cellules attaquées par le virus sont détruites.

    Institut Pasteur/CNR des virus des infections respiratoires à l’Institut Pasteur 61439
    Effet cytopathogène du Coronavirus 2019-nCoV sur cellules Vero E6

     

  • Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2
    Cellules bronchiques humaines (en vert) infectées par SARS-CoV-2 (orange). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
    Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62016
    Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2

     

  • Arbre phylogénétique de 950 génomes du SARS-CoV-2
    Arbre phylogénétique calibré dans le temps de 950 génomes du SARS-CoV-2 partagés librement par la communauté scientifique. Les pointes de l’arbre sont colorées en fonction de leur date échantillonnage.
    Arbre inféré et visualisé avec Nextstrain (Hadfield et al., Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution, Bioinformatics (2018)).

    Institut Pasteur/Etienne Simon-Lorière - Génomique évolutive des virus à ARN 61931
    Arbre phylogénétique de 950 génomes du SARS-CoV-2

     

  • Cellule ciliée infectée par le SARS-CoV-2
    Image par microscopie électronique à balayage d’une cellule ciliée (en vert) infectée par le SARS-CoV-2, avec quelques cils restants et des particules virales (colorisées en bleu) dispersées au niveau de la membrane plasmique.
    Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62630
    Cellule ciliée infectée par le SARS-CoV-2

     

  • Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2
    Cellules bronchiques humaines (en bleu) infectées par SARS-CoV-2 (rose). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
    Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62017
    Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2

     

  • Cellules humaines infectées par SARS-CoV-2
    Cellules humaines infectées par SARS-CoV-2.
    En vert les cellules ayant fusionné et formé des syncytia, en rouge, production de la Spike, en bleu les noyaux cellulaires.

    Institut Pasteur 62711
    Cellules humaines infectées par SARS-CoV-2

     

  • Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2
    Cellules bronchiques humaines (en bleu) infectées par SARS-CoV-2 (orange). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
    Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62019
    Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2

     

  • Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2
    Cellules bronchiques humaines (en orange) infectées par SARS-CoV-2 (vert). Image obtenue par microscopie électronique à balayage puis colorisée.
    Institut Pasteur. Image par Rémy Robinot, Mathieu Hubert, Vincent Michel, Olivier Schwartz et Lisa Chakrabarti, et colorisée par Jean Marc Panaud 62020
    Cellules bronchiques humaines infectées par SARS-CoV-2

     

  • Tapis cellulaire non abîmé par les virus.
    Tapis cellulaire non abîmé par les virus.
    Institut Pasteur/CNR des virus des infections respiratoires à l’Institut Pasteur 61438
    Tapis cellulaire non abîmé par les virus.

     

  • Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron
    Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron, vue latérale.
    Les mutations sont indiquées en rouge. Les mutations sont présentes sur toute la protéine Spike, mais s’accumulent au niveau de la zone de liaison au récepteur (Receptor Binding Domain ou RBD, coloré en jaune) et dans une région appelée N-terminal Domain (NTD).

    Institut Pasteur/Olivier Schwartz et Félix Rey 64307
    Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron

     

  • Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron
    Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron, vue de dessus.
    Les mutations sont indiquées en rouge. Les mutations sont présentes sur toute la protéine Spike, mais s’accumulent au niveau de la zone de liaison au récepteur (Receptor Binding Domain ou RBD, coloré en jaune) et dans une région appelée N-terminal Domain (NTD).

    Institut Pasteur/Olivier Schwartz et Félix Rey 64306
    Visualisation en 3D des mutations de la Spike du variant Omicron

     

  • Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2
    Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2.
    Après acquisition des images en 2D avec le microscope Titan Krios, on peut procéder à la transformation de ces images en 3 Dimensions (3D) avec un programme appelé IMOD. On voit alors plus clairement que le SARS-CoV2 est présent à la fois sur et dans les connexions.
    L'objectif de l'étude est d'explorer comment le SARS-CoV-2 atteint le cerveau. Expérience réalisée par Anna Pepe sous la supervision de Chiara Zurzolo, directrice de l'unité Trafic membranaire et pathogénèse. Les échantillons cryogéniques ont été acquis par Anna Pepe en utilisant le microscope Krios-Titan à l'Institut Pasteur (Nanoimaging Institut Pasteur).

    Institut Pasteur/Anna Pepe et Chiara Zurzolo 65077
    Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2

     

  • Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2
    Cette vidéo montre les connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2.
    L'objectif de l'étude est d'explorer comment le SARS-CoV-2 atteint le cerveau. Expérience réalisée par Anna Pepe sous la supervision de Chiara Zurzolo, directrice de l'Unité Trafic membranaire et pathogénèse.
    Les échantillons cryogéniques ont été acquis par Anna Pepe en utilisant le microscope Krios-Titan à l'Institut Pasteur (Nanoimaging Institut Pasteur).

    Institut Pasteur/Anna Pepe & Chiara Zurzolo 65071
    Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2

     

  • Plusieurs cellules connectées par des nanotubes.
    Plusieurs cellules connectées par des nanotubes.
    Institut Pasteur/Trafic Membranaire et Pathogénèse 63295
    Plusieurs cellules connectées par des nanotubes.

     

  • Particules virales de SARS-CoV-2 à l’intérieur et à la surface d’un nanotube
    Des particules virales de SARS-CoV-2 (en bleu foncé) à l’intérieur et à la surface d’un nanotube. Tomographie Cryo-EM segmentée réalisée avec le logiciel AMIRA.
    Le SARS-CoV-2 détourne les nanotubes reliant les neurones afin de les infecter.

    Institut Pasteur/Anna Pepe 63294
    Particules virales de SARS-CoV-2 à l’intérieur et à la surface d’un nanotube