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Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2.
Après acquisition des images en 2D avec le microscope Titan Krios, on peut procéder à la transformation de ces images en 3 Dimensions (3D) avec un programme appelé IMOD. On voit alors plus clairement que le SARS-CoV2 est présent à la fois sur et dans les connexions.
L'objectif de l'étude est d'explorer comment le SARS-CoV-2 atteint le cerveau. Expérience réalisée par Anna Pepe sous la supervision de Chiara Zurzolo, directrice de l'unité Trafic membranaire et pathogénèse. Les échantillons cryogéniques ont été acquis par Anna Pepe en utilisant le microscope Krios-Titan à l'Institut Pasteur (Nanoimaging Institut Pasteur).
Institut Pasteur/Anna Pepe et Chiara Zurzolo 65077
Connexions créées par des cellules humaines infectées par le SRAS-CoV-2 -
L'équipement en fonctionnement dans cette vidéo est le microscope à balayage AQUILOS 2 de la société THERMO FISHER.
Cet équipement (unique en France en 2023) permet de faire des lamelles extrêmement fines à partir de divers types d'échantillon, à l'aide d'un faisceau d'ion de Gallium, tout en combinant l'observation du processus à l'aide d'un faisceau d'électron.
Le processus affiché dans la vidéo représente une découpe de cellule en direct à partir d'un échantillon refroidit à température cryogénique (-190°C).
L'échantillon en question a été préparé à partir de cellules cultivées sur une grille de microscope électronique (3mm de diamètre), et qui a été congelé dans l'éthane liquide, puis stocké dans l'azote liquide.
Institut Pasteur/Stéphane Tachon 65072
Utilisation du microscope à balayage AQUILOS 2 de la société THERMO FISHER -
Vidéo montrant les détails structurales des connexions (Tunneling Nanotubes TNT) entre des cellules neuronales humaines L'objectif de cette recherche est de comprendre comment les neurones communiquent entre eux dans des conditions physiologiques et pathologiques telles que la neurodégénérescence.
Les expériences ont été réalisées sous la supervision de Chiara Zurzolo, directrice de l’unité Trafic membranaire et pathogénèse. Anna Pepe (unité Trafic membranaire et pathogénèse) et Anna Sartori (Plateforme Technologique Nanoimagerie) ont acquis les échantillons à l'aide d'un cryo-microscope Tencai 20 (Institut Pasteur, unité de BioImagerie Ultrastructurale).
Institut Pasteur/Anna Sartori-Rupp, Anna Pepe et Chiara Zurzolo 65070
Détails structurales des connexions entre cellules neuronales humaines -
Des particules virales de SARS-CoV-2 (en bleu foncé) à l’intérieur et à la surface d’un nanotube. Tomographie Cryo-EM segmentée réalisée avec le logiciel AMIRA.
Le SARS-CoV-2 détourne les nanotubes reliant les neurones afin de les infecter.
Institut Pasteur/Anna Pepe 63294
Particules virales de SARS-CoV-2 à l’intérieur et à la surface d’un nanotube -
Bactériophages SPP1 observés en cryomicroscopie (microscope JEOL 2010F).
Institut Pasteur/Gérard Pehau-Arnaudet 56149
Bactériophages SPP1 observés en cryomicroscopie -
Bactériophage T4 vu en microscopie électronique (coloration négative).
Le Bactériophage T4 est spécifique de la bactérie Escherichia coli.
Institut Pasteur/Eric Larquet - Plate-Forme de Microscopie Electronique 56148
Bactériophage T4 -
Biofilm viral formé de particules de VIH-1 enchâssées dans de la matrice extracellulaire révélée par immunogold en cryo-MEB.
© Institut Pasteur/Catherine Inizan et Maria-Isabel Thoulouze, unité de virologie Structurale; Adeline Mallet, Plateforme de microscopie ultrastructurale, Imagopole. 40915
Biofilm viral formé de particules de VIH-1 -
Tore d'ADN piégé dans la capside d'un bactériophage.
On peut former des tores avec l'ADN contenu à l'intérieur de la capside des bactériophages (ici le coliphage T5). Après éjection partielle de l'ADN du bactériophage, la partie de la chaîne encore encapsidée s'effondre sur elle-même sous forme torique lorsqu'elle est mise en présence de polycations, agents de condensation de l'ADN. Tore observé en vue apicale. La longueur de la molécule est de l'ordre de 15 à 20 micromètres, et le diamètre de la capside 80 nanomètres.
Technique/matériel de microscopie : Cryo-microscopie électronique à transmission.
© Institut Pasteur/Amélie Leforestier, Laboratoire de Physique des Solides - CNRS - Université Paris Sud en collaboration avec Gérard Pehau-Arnaudet, Plate-Forme de Microscopie Ultrastructurale 38371
Tore d'ADN piégé dans la capside d'un bactériophage -
Tores d'ADN piégés dans des capsides de bactériophages.
On peut former des tores avec l'ADN contenu à l'intérieur de la capside des bactériophages (ici le coliphage T5). Après éjection partielle de l'ADN du bactériophage, les chaînes d'ADN s'effondrent sur elles-mêmes sous forme torique lorsqu'elles sont mises en présence de polycations, agents de condensation de l'ADN. Ici les tores sont observés en vues obliques et transversales. On observe alors le réseau hexagonal formé par l'ADN dans le tore. Le diamètre de la capside est de 80 nanomètres.
Technique/microscopie : Cryo-microscopie électronique à transmission
© Institut Pasteur/Amélie Leforestier, Laboratoire de Physique des Solides - CNRS - Université Paris Sud en collaboration avec Gérard Pehau-Arnaudet, Plate-Forme de Microscopie Ultrastructurale 38370
Tores d'ADN piégés dans des capsides de bactériophages -
Escherichia coli mc410.
Observation en glace vitreuse (plunge freezing)
© Institut Pasteur/Gérard Pehau-Arnaudet 28946
Escherichia coli mc4100 -
Escherichia coli mc410.
Observation en glace vitreuse (plunge freezing)
© Institut Pasteur/Gérard Pehau-Arnaudet 28945
Escherichia coli mc4100 -
Détail de la surface d'une conidie du champignon filamenteux Aspergillus fumigatus en Cryo-Microscopie Electronique à Balayage.
Cette surface est composée de protéines (hydrophobines) qui sont inertes immunologiquement. Cela explique pourquoi le corps humain ne réagit pas aux milliers de conidies présentes dans l'air et inhalées chaque jour.
© Institut Pasteur/Stéphanie Guadagnini, Plate-Forme de Microscopie Ultrastructurale - Anne Beauvais, unité Aspergillus 27245
Détail de la surface d'une conidie d'Aspergillus fumigatus -
Image en microscopie à cryo-balayage d'une culture agée de mycélium d'Aspergillus fumigatus en conditions statique et aérienne montrant la matrice extra-cellulaire recouvrant les hyphes.
© Institut Pasteur/Stéphanie Guadagnini, Plate-forme de microscopie ultrastructurale - Anne Beauvais , unité Aspergillus 27231
Image en microscopie à cryo-balayage d'une culture agée de mycélium d'Aspergillus fumigatus -
Image en microscopie à cryo-balayage montrant un mycélium d'Aspergillus fumigatus cultivé en conditions statique et aérienne.
© Institut Pasteur/Stéphanie Guadagnini - Plate-forme de microscopie ultrastructurale - Anne Beauvais, unité Aspergillus 27230
Image en microscopie à cryo-balayage montrant un mycélium d'Aspergillus fumigatus -
Section transversale d'hyphes d'une culture mycélienne d'Aspergillus fumigatus en conditions statique et aérienne, observée en microscopie à cryo-balayage.
Cryo scanning electron microscopy section of static and aerial growing mycelium.
© Institut Pasteur/Stéphanie Guadagnini - Plate-forme de microscopie ultrastructurale - Anne Beauvais, unité Aspergillus 27229
Section transversale d'hyphes d'une culture mycélienne d'Aspergillus fumigatus -
Image en microscopie à cryo-balayage montrant un mycélium d'Aspergillus fumigatus cultivé en conditions statique et aérienne.
© Institut Pasteur/Stéphanie Guadagnini - Plate-forme de microscopie ultrastructurale - Anne Beauvais, unité Aspergillus 27228
Image en microscopie à cryo-balayage montrant un mycélium d'Aspergillus fumigatus -
Image en microscopie à cryo-balayage montrant un hyphe d'Aspergillus fumigatus issu d'une culture statique et aérienne et recouvert d'un matériel extra-cellulaire le protégeant de la déssication.
© Institut Pasteur/Stéphanie Guadagnini - Plate-forme de microscopie ultrastructurale - Anne Beauvais, unité Aspergillus 27227
Image en microscopie à cryo-balayage montrant un hyphe d'Aspergillus fumigatus -
Image en microscopie à cryo-balayage d'une conidie en cours de germination.
© Institut Pasteur/Stéphanie Guadagnini - Plate-forme de microscopie ultrastructurale - Anne Beauvais, unité Aspergillus 27223
Image en microscopie à cryo-balayage d'une conidie en cours de germination -
Image en microscopie à cryo-balayage d'une conidie en cours de germination.
© Institut Pasteur/Stéphanie Guadagnini - Plate-forme de microscopie ultrastructurale - Anne Beauvais, unité Aspergillus 27220
Image en microscopie à cryo-balayage d'une conidie en cours de germination -
Image en microscopie à cryo-balayage montrant les ornementations ou rodlets présents à la surface des conidies d'Aspergillus fumigatus.
© Institut Pasteur/Stéphanie Guadagnini - Plate-forme de microscopie ultrastructurale - Anne Beauvais, unité Aspergillus 27218
Surface des conidies d'Aspergillus fumigatus